En febrero de 2001, la Comisión de Acreditación de la AABC otorgó a la Universidad Pentecostal Mizpa el estatus de Initial Accreditation. Igualmente, recibió la Certificación de Elegibilidad del Departamento de Educación de los Estados Unidos para participar en los Programas de ayuda económica federal (Título IV). En el año académico 2003 – 2004 la UPM comenzó a ofrecer la Beca PELL.
En el año 2005, la UPM comienza a participar del Programa de estudio y trabajo y recibe la certificación de SEVIS para estudiantes extranjeros. En febrero de 2006, obtiene la reafirmación de la acreditación por los próximos diez años bajo ABHE para el Recinto de San Juan y los Centros de Extensión de Humacao y Manatí. Centros que se habían abierto en aquella época.
La UPM es la primera institución educativa del pentecostalismo puertorriqueño con una amplia visión y fuerte compromiso. Su encomienda es perfeccionar a los santos para la obra del ministerio y capacitar personas al servicio de la obra de Dios. Nuestro deseo es seguir trabajando hacia este fin, así nos ayude Dios.